Kariéra na OU

Specialista – bioinformatik / specialistka – bioinformatička se zaměřením na vývoj softwaru a webových aplikací v hematoonkologii

HR logo

Děkan Lékařské fakulty Ostravské univerzity vyhlašuje výběrové řízení na pozici:

  • Specialista – bioinformatik / specialistka – bioinformatička se zaměřením na vývoj softwaru a webových aplikací v hematoonkologii

Pracoviště

  • Lékařská fakulta, Klinika hematoonkologie

Typ systemizovaného místa

  • Specialista II

  • Výzkumný program VP6 Výzkum a vývoj nových terapeutických metod u krevních nádorů.
  • Pracovní pozice vznikla za finanční podpory Evropské unie v rámci projektu LERCO s reg. číslem CZ.10.03.01/00/22_003/0000003, prostřednictvím Operačního programu spravedlivá transformace.

Popis pracovní náplně

  • Vyvíjí a optimalizuje bioinformatické aplikace a analytické pipeline pro automatizované zpracování sekvenačních dat DNA a RNA.
  • Převádí stávající analytické pipeline ze Snakemake do Nextflow a zajišťuje kontejnerizaci výpočetních prostředí pro reprodukovatelnost analýz.
  • Provádí bioinformatické analýzy sekvenačních dat na výpočetních clusterech a superpočítačích.
  • Podílí se na vývoji a správě webových aplikací a nástrojů pro zpřístupnění bioinformatických analýz a jejich výsledků.
  • Zajišťuje údržbu, dokumentaci a průběžný rozvoj bioinformatického softwaru a analytických postupů.
  • Spolupracuje s výzkumným týmem na interpretaci výsledků, přípravě odborných publikací a vzdělávacích aktivitách v oblasti bioinformatiky.

Kvalifikační předpoklady – požadujeme

  • Ukončené vysokoškolské vzdělání minimálně magisterského stupně v oboru biologie, bioinformatika nebo informatika.
  • Praktická zkušenost s vývojem bioinformatických aplikací a analytických pipeline.
  • Znalost programovacích jazyků Bash, Python a R.
  • Znalost nástrojů Git a GitHub a správce balíčků Conda.
  • Znalost nástrojů pro řízení analytických workflow Snakemake nebo Nextflow.
  • Zkušenost s vývojem webových aplikací.
  • Zkušenost s prací na výpočetních clusterech nebo superpočítačích.
  • Zkušenost s biologicky nebo biomedicínsky zaměřeným výzkumem.
  • Znalost anglického jazyka (C1) pro dorozumění se s našimi zahraničními vědeckými pracovníky a se zahraničními dodavateli.
  • Schopnost efektivně komunikovat.
  • Schopnost samostatné i týmové práce.
  • Spolehlivost, pečlivost, proaktivní a zodpovědný přístup.
  • Velmi dobré organizační schopnosti a ochota rychle se učit nové postupy.

Kvalifikační předpoklady – výhodou

  • Znalost kontejnerizačních nástrojů Docker a Singularity.
  • Teoretické znalosti molekulární biologie a hematologie.
  • Ukázky vlastní softwarové práce dostupné v repozitáři GitHub nebo GitLab.

Předpokládaný pracovní úvazek

  • 100 %

Doba trvání pracovního poměru

  • na dobu určitou, po dobu realizace projektu LERCO – do 31. prosince 2027

Předpokládaný termín nástupu

  • leden 2027 nebo dle dohody

Mzdové podmínky

  • Mzda se odvíjí od zařazení dle vnitřního mzdového předpisu univerzity a je odvislá rovněž od zkušeností uchazeče/uchazečky.

Benefity

  • 6 týdnů dovolené za kalendářní rok.
  • 5 dnů volna k léčení.
  • Stravenky v hodnotě 123 Kč/den.
  • Pružná pracovní doba a možnost příležitostného výkonu práce z domova.
  • Podpora sportovních aktivit, např. prostřednictvím zaměstnaneckého programu MultiSport.
  • Kurzy anglického jazyka a jiné vzdělávací kurzy.
  • Slevy na nájemném u společnosti Heimstaden.
  • Školka Elánek pro děti zaměstnanců a 50% sleva na školkovném.
  • Služby Univerzitní knihovny a přístup k e-knihám zdarma.
  • 15% sleva na knihy v Univerzitním obchodu a knihkupectví – OUShopu.
  • Zvýhodněné ceny mobilních tarifů v rámci benefitního programu T-mobile.
  • Práce v profesionálním týmu u stabilního zaměstnavatele.
  • Vstřícná politika a kultura organizace, příjemné pracovní prostředí.

Jazyk, ve kterém proběhne výběrové řízení

  • český a/nebo anglický

Požadované dokumenty od účastníka

Lhůta pro včasné podání žádosti

  • 20. listopadu 2026 (včetně)

Informace o výběrovém řízení

  • 1. kolo – posouzení zaslaných dokumentů, bez osobní přítomnosti uchazečů.
  • 2. kolo – osobní pohovor s vybranými uchazeči.

Děkan Lékařské fakulty OU si vyhrazuje právo pozvat k osobnímu pohovoru pouze vybrané uchazeče/uchazečky a rovněž právo nevybrat žádného uchazeče / žádnou uchazečku. Výběrové řízení může zrušeno nebo vyhlášeno opakovaně.

Kontakt





Pavel Flegontov získal Cenu předsedy GA ČR

Vědec Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity Pavel Flegontov převzal ocenění předsedy Grantové agentury ČR. Zaujal projektem, který pomáhá zvýšit spolehlivost výzkumu dávné lidské DNA a mísení lidských populací.